研究組介紹
一、研究組簡介
自然界中,植物與微生物長期相互作用,共同進化,形成了復雜的關系。依據微生物對植物的影響,可分為有益、有害和中性微生物。
本研究組通過對植物-微生物互作關系的研究,特別是對其背后分子機理的深入解析,為建立可持續發展的現代農業,保護生態環境,開發利用植物產物提供理論基礎和解決方案。
二.研究方向
1. 植物-有害微生物 研究組將聚焦江西和我國主要植物特別是農作物的病害。在收集植物種質資源,分離病原菌的基礎上,研究組將利用基因組學和分子生物學手段,通過生物化學、細胞生物學、遺傳學和生物信息學等,定位克隆抗病基因,調查背后的分子機制,并在此基礎上進行抗病設計并結合分子輔助育種,培養抗病的植物新品種,為控制植物病害提供可持續的環境友好的綠色方案。
2. 植物-有益微生物 共生是一種協同互利的關系。比如在豆科植物中,植物通過光合作用固定能源提供給共生的固氮菌,而固氮菌可以通過固氮提供植物氮源。這種關系只能建立在特定的微生物和特定的植物之間。研究組將調查收集當地的有共生微生物的植物物種,利用現代分子生物學技術,調查植物和微生物的對應關系,并調查背后的分子原理,為減少化肥施用,提高植物生物產量提供理論基礎。
3. 植物-內生微生物 植物體內分布著大量微生物。它們與植物在長期的協同進化中,形成了動態的微生態平衡,表現出對植物微利、中性和微害,而這些關系可隨著條件的變化而相互轉化。研究組將關注內生微生物對宿主植物抗病的影響以及對宿主植物代謝產物的影響。
另外,研究組也開發一些植物核酸檢測的技術。
研究組長

| 姓 名: | 劉小坤 | 研 究 組: | 植物與微生物互作研究組 |
|---|---|---|---|
| 職 務: | 研究組長 | 職 稱: | 研究員 |
| 通訊地址: | 江西省南昌市新建區溪霞現代農業園廬山植物園南昌科研中心 | ||
| 郵政編碼: | 330014 | 電子郵箱: | Xiaokun.liu@lsbg.cn |
| 姓 名: | 劉小坤 |
|---|---|
| 研 究 組: | 植物與微生物互作研究組 |
| 職 務: | 研究組長 |
| 職 稱: | 研究員 |
| 通訊地址: | 江西省南昌市新建區溪霞現代農業園廬山植物園南昌科研中心 |
| 郵政編碼: | 330014 |
| 電子郵箱: | Xiaokun.liu@lsbg.cn |
學習經歷:
2011年-2015年 德國圖賓根大學 獲博士學位
1998年-2001年 中山大學、上海植生所 獲碩士學位
1991年-1995年 安徽師范大學 獲學士學位
工作經歷:
2021年-現在 江西省中科院廬山植物園植物與微生物互作組長
2015年-2021年 英國約翰英納斯中心博士后、瑪麗居里學者
2010年-2011年 瑞典農業大學 研究人員
2003年-2010年 新加坡國立大學 研究助理
2001年-2003年 上海復星高科技公司 研發經理
1995年-1998年 安徽水陽高級中學 生物教師
獲獎及榮譽:
2017年 獲得歐盟地平線計劃瑪麗居里博后基金
2021年 江西省高層次和急需緊缺海外人才引進計劃
研究領域:
植物抗病,核酸檢測
承擔科研項目情況:
1. 中國科學院廬山植物園廬山植物專項:番茄晚疫病的抗病研究(2021-2023),主持
2. 江西省自然科學基金面上項目:番茄晚疫病感病基因挖掘(2022-2025),主持
3. 江西省引智急需緊缺海外人才項目:饑餓抗病理論的應用(2021-2022),主持
論文及論著:
1. 論文
[1]. Pengpeng Lü; Yi Liu; Xixi Yu; Chun-Lin Shi; Xiaokun Liu ; The right microbe-associated molecular patterns for effective recognition by plants, Frontiers in Microbiology, 2022,13
[2]. Derba-Maceluch, M., et al., Xylan glucuronic acid side chains fix suberin-like aliphatic compounds to wood cell walls. New Phytol, 2023. 238(1): p. 297-312
[3]. Liu X, Grabherr HM, Willmann R, Kolb D, Brunner F, Bertsche U, Kühner D, Franz-Wachtel M, Amin B, Felix G, Ongena M, Nürnberger T, Gust AA.. Host-induced bacterial cell wall decomposition mediates pattern-triggered immunity in Arabidopsis. eLife. 2014 Jun 23: e01990. (Jun 23, 2014)
[4]. C. Cheval, S. Samwald, M. G. Johnston, J. D. Keijzer, A. Breakspear, X. Liu, A. Bellandi, Y. Kadota, C. Zipfel, C. Faulkner. (2020) Chitin perception in plasmodesmata characterizes submembrane immune-signaling specificity in plants. PNAS. April 2020, 117 (17): 9621-9629. (April 28, 2020)
[5]. Rosas-Diaz T., Zhang D., Fan P., Wang L., Ding X., Jiang Y., Jimenez-Gongora T., Medina-Puche L., Zhao X., Feng Z., Zhang G., Liu X., Bejarano E. R., Tan L., Zhang H., Zhu J. K., Xing W., Faulkner C., Nagawa S., Lozano-Duran R. (2018) A virus-targeted plant receptor-like kinase promotes cell-to-cell spread of RNAi. PNAS. 2018 Feb, 115(6):1388-1393. ( January 23, 2018)
[6]. Latha Gandla M, Derba-Maceluch M, Liu X, Gerber L, Master ER, Mellerowicz EJ, J?nsson LJ Expression of a fungal glucuronoyl esterase in Populus: Effects on wood properties and saccharification efficiency. Phytochemistry 2014.06.002. (2 July 2014)
[7]. Wang CM1, Liu P, Yi C, Gu K, Sun F, Li L, Lo LC, Liu X, Feng F, Lin G, Cao S, Hong Y,Yin Z, Yue GH: A first generation microsatellite- and SNP-based linkage map of Jatropha. PloS one 2011;6(8):e23632. (August 25, 2011)
[8]. Yi CX, Zhang SL, Liu XK, Hong Y: Does epigenetic polymorphism contribute to phenotypic variances in Jatropha curcas L.BMC Plant Biology 2010, 10:259. (23 November 2010)
[9]. Liu, XK, HY Law, YM Tan and Y Hong: High-throughput β-thalassemia carrier screening by allele-specific Q-primer real-time polymerase chain reaction. Analytical Biochemistry 404: 97-99 (2010). (2010 Sep 1)
[10]. Yi, CX, J Zhang, KM Chan, Liu XK and Y Hong: Quantitative real-time PCR assay to detect transgenic copy number in cotton (Gossypium hirsutum). Analytical Biochemistry 375: 150-152 (2008). ( 2008 Apr)
[11]. Liu, XK and Y Hong: Q-priming PCR: A quantitative real-time PCR system using a self-quenched BODIPY FL-labeled primer. Analytical Biochemistry 360: 154-156 (2007). (2007 Jan 1)
[12]. Hong, DYQ, AJ Lau, CL Yeo, XK Liu, CR Yang, HL Koh and Y Hong: Genetic diversity and variation of saponin contents in Panax notoginseng roots from a single farm. Journal of Agricultural and Food Chemistry 53: 8460-8467 (2005). (2005 Nov)
[13]. Ao Chen-Qi, Liu Xiao-Kun. A simple method for preparing pollen specimen in light microscope. Chinese Bulletin of Botany. 18(2):251(2001). (2001-mar-20)
2. 專利
[14]. Liu Xiaokun, Hong Yan. 06824649.5-2402/1960542 PCT/SG 2006000378 Fluorescent primer system for detection of nucleic acid (Q-priming system). (14.06.2007)
3. 專著
Y Hong and Liu, XK: Real time fluorescent PCR by labeled primer with a single fluorescent molecule. 2014, PCR. Technology Current Innovations 3rd edition, CRC press. (June 2013)
研究組員

| 姓 名: | 呂朋朋 | 研 究 組: | 植物與微生物互作研究組 |
|---|---|---|---|
| 職 務: | 研究組員 | 職 稱: | 助理研究員 |
| 通訊地址: | 江西省南昌市新建區溪霞現代農業園廬山植物園南昌科研中心 | ||
| 郵政編碼: | 330014 | 電子郵箱: | lvpeng0903@163.com |
| 姓 名: | 呂朋朋 |
|---|---|
| 研 究 組: | 植物與微生物互作研究組 |
| 職 務: | 研究組員 |
| 職 稱: | 助理研究員 |
| 通訊地址: | 江西省南昌市新建區溪霞現代農業園廬山植物園南昌科研中心 |
| 郵政編碼: | 330014 |
| 電子郵箱: | lvpeng0903@163.com |
學習經歷:
2014年-2021年 中國科學院大學 獲博士學位
2009年-2013年 吉林農業大學 獲學士學位
工作經歷:
2022年3月-至今 中國科學院廬山植物園植物與微生物互作組組員
任職經歷:
2022年3月-至今 中國科學院廬山植物園 任助理研究員
研究領域:
微生物生態,植物與微生物互作
承擔科研項目情況:
1.亞熱帶森林中叢枝菌根真菌與植物多樣性互作機制研究,國家自然科學基金青年項目,2018.1–2020.12,結題,參與
論文及論著:
1. Pengpeng Lü; Yi Liu; Xixi Yu; Chun-Lin Shi; Xiaokun Liu ; The right microbe-associated molecular patterns for effective recognition by plants, Frontiers in Microbiology, 2022,13
2. Lü PP,Zheng Y,Chen L,Ji NN,Wu BW,Yao H,Maitra P,Hu HW,Li XC,Guo LD.Irrigation and fertilization effects on AM fungi depend on growing season in a dryland maize agroecosystem. Pedobiologia, 2020, 83:150687.
3. Maitra P,Zheng Y,Wang YL,Mandal D,Lü PP,Gao C,Babalola BJ, Ji NN,Li XC,Guo LD.Phosphorus fertilization rather than nitrogen fertilization, growing season and plant successional stage structures arbuscular mycorrhizal fungal community in a subtropical forest. Biology and Fertility of Soils, 2021, 57(5): 685-697.
4. Li JL,Sun X,Zheng Y,Lü PP,Wang YL,Guo LD.Diversity and community of culturable endophytic fungi from stems and roots of desert halophytes in northwest China. MycoKeys, 2020, 62:75.
5. Li ZF,Lü PP,Wang YL,Yao H,Maitra P,Sun X,Zheng Y,Guo LD.Response of arbuscular mycorrhizal fungal community in soil and roots to grazing differs in a wetland on the Qinghai-Tibet plateau. PeerJ, 2020, 8: e9375.
6. Wang YL,Gao C,Chen L,Ji NN,Wu BW,Lü PP,Li XC,Qian X,Maitra P,Babalola, BJ,Zheng Y,Guo LD. Community assembly of endophytic fungi in ectomycorrhizae of Betulaceae plants at a regional scale. Frontiers in Microbiology, 2020, 10.
7. Ji NN,Gao C,Sandel B,Zheng Y,Chen L,Wu BW,Li XC,Wang YL,Lü PP,Sun X,Guo LD.Late Quaternary climate change explains soil fungal community composition rather than fungal richness in forest ecosystems. Ecology and Evolution, 2019, 9(11): 6678-6692.
8. Maitra P,Zheng Y,Chen L,Wang YL,Ji NN,Lü PP,Gan HY, Li XC,Sun X,Zhou XH,Guo LD.Effect of drought and season on arbuscular mycorrhizal fungi in a subtropical secondary forest. Fungal Ecology, 2019, 41: 107-115.
9. Wang YL,Gao C,Chen L,Ji NN,Wu BW,Li XC,Lü PP,Zheng Y,Guo LD.Host plant phylogeny and geographic distance strongly structure Betulaceae-associated ectomycorrhizal fungal communities in Chinese secondary forest ecosystems. FEMS Microbiology Ecology, 2019, 95: fiz037.
10. Qian X,Duan TT,Sun X,Zheng Y,Wang YL,Hu ML,Yao H,Ji NN,Lü PP,Chen L,Shi MM,Guo LD,Zhang DX.Host genotype strongly influences phyllosphere fungal communities associated with Mussaenda pubescens var. alba (Rubiaceae). Fungal Ecology, 2018, 36: 141-151.
11. Wu BW,Gao C,Chen L,Buscot F,Goldmann K,Purahong W,Ji NN,Wang YL,Lü PP,Li XC,Guo LD.Host phylogeny is a major determinant of Fagaceae-associated ectomycorrhizal fungal community assembly at a regional scale. Frontiers in Microbiology, 2018, 9: 2409.
研究組員

| 姓 名: | 裘博文 | 研 究 組: | 植物與微生物互作研究組 |
|---|---|---|---|
| 職 務: | 研究組員 | 職 稱: | 研究實習員 |
| 通訊地址: | 江西省南昌市新建區溪霞現代農業園廬山植物園南昌科研中心 | ||
| 郵政編碼: | 330014 | 電子郵箱: | qiubowenll@163.com |
| 姓 名: | 裘博文 |
|---|---|
| 研 究 組: | 植物與微生物互作研究組 |
| 職 務: | 研究組員 |
| 職 稱: | 研究實習員 |
| 通訊地址: | 江西省南昌市新建區溪霞現代農業園廬山植物園南昌科研中心 |
| 郵政編碼: | 330014 |
| 電子郵箱: | qiubowenll@163.com |
學習經歷:
2015年-2022年 延安大學 獲理學學士、碩士學位
工作經歷:
2022年11月-至今 中國科學院廬山植物園植物與微生物互作組組員
任職經歷:
2022年11月-至今 中國科學院廬山植物園 研究實習員
研究領域:
動物生理,植物與微生物互作
論文及論著:
1. Qiu BW, Hao LL, Deng XW, Luo N, Zhao HQ, Lai BY, Sun ZH. Effects of Pennisetum giganteum on blood biochemical parameters and expression of fat related genes in Phasianus colchicus. Animal Husbandry & Veterinary Medicine, 2021, 53(01): 36-42.
2. Qiu BW, Deng XW, Hao LL, Zhao HQ, Zhao K,Yao H, Qi XY, Sun ZH. Effect of Pennisetum giganteum on growth performance, immune organs and intestinal villi of colorful pheasants. Feed Research, 2020. 03. 007.
3. Deng XW, Qiu BW, Hao LL, Xu Y, Luo N, Sun ZH. Effects of addition of fermented Pennisetum giganteum in ration on the blood biochemical parameters of BAMA miniature pig in the growth period. Feed Industry, 2020.06.004.
研究組員

| 姓 名: | 黃瑤 | 研 究 組: | 植物與微生物互作研究組 |
|---|---|---|---|
| 職 務: | 學生 | 職 稱: | |
| 通訊地址: | 江西省南昌市溪霞鎮溪霞國家現代農業示范區科研中心 | ||
| 郵政編碼: | 330014 | 電子郵箱: | 2781676125@qq.com |
| 姓 名: | 黃瑤 |
|---|---|
| 研 究 組: | 植物與微生物互作研究組 |
| 職 務: | 學生 |
| 職 稱: | |
| 通訊地址: | 江西省南昌市溪霞鎮溪霞國家現代農業示范區科研中心 |
| 郵政編碼: | 330014 |
| 電子郵箱: | 2781676125@qq.com |
學習經歷:
2022年9月-至今 南昌大學
2018年9月-2022年6月 贛南師范大學


